Inventory number | IRN | Number of state registration |
---|---|---|
0224РК00099 | AP14869967-OT-24 | 0122РК00313 |
Document type | Terms of distribution | Availability of implementation |
Заключительный | Gratis | Number of implementation: 0 Not implemented |
Publications | ||
Native publications: 2 | ||
International publications: 2 | Publications Web of science: 1 | Publications Scopus: 1 |
Number of books | Appendicies | Sources |
1 | 4 | 39 |
Total number of pages | Patents | Illustrations |
68 | 0 | 13 |
Amount of funding | Code of the program | Table |
29235101.35 | AP14869967 | 7 |
Name of work | ||
Картирование генетических факторов, детерминирующих устойчивость к Septoria nodorum, на основе полногеномного исследования ассоциаций в коллекции гексаплоидной пшеницы | ||
Report title | ||
Type of work | Source of funding | The product offerred for implementation |
Fundamental | Коллекции | |
Report authors | ||
Кохметова Алма Мырзабековна , Кумарбаева Мадина Талгаровна , Кеишилов Женис Советканович , Жанузақ Данна Көмекқызы , Болатбекова Ардак Айдыновна , Бахытұлы Қанат , Малышева Ангелина Александровна , Кохметова Асия Мырзабековна , Мухаметжанов Канат Серикханович , | ||
0
0
0
0
|
||
Customer | МНВО РК | |
Information on the executing organization | ||
Short name of the ministry (establishment) | МНВО РК | |
Full name of the service recipient | ||
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений" | ||
Abbreviated name of the service recipient | РГП на ПХВ «ИББР» | |
Abstract | ||
220 казахстанских и зарубежных сортов и линий гексаплоидной пшеницы Гексаплоидты бидайдың 220 қазақстандық және шетелдік сорттары мен линияларынан тұратын коллекциясы. Картирование генетических факторов, детерминирующих устойчивость к Septoria nodorum, на основе полногеномного исследования ассоциаций в коллекции гексаплоидной пшеницы Қазақстандық гексаплоидты бидай коллекциясының бүкіл геномдық ассоциацияларын зерттеу (GWAS) негізінде Septoria nodorum төзімділігін айқындайтын генетикалық факторларды карталау. оценка полевой устойчивости к S. nodorum – по методике Saari, Prescott (1975); оценка проростковой устойчивости к расам гриба – по шкале Lamari, Bernier (1989); структуру популяции оценивали по программе STRUCTURE 2.3.4; PCA анализ – по PAST v.3.15; матрикс родства сортов – по TASSEL v. 5.2.24. S. nodorum-ға егіс алқабындағы төзімділікті бағалау – Saari, Prescott әдістемесі бойынша (1975); саңырауқұлақ расаларына өскіндегі төзімділікті бағалау – Lamari, Bernier шкаласы бойынша (1989); популяция құрылымы STRUCTURE 2.3.4 бойынша; PCA талдауы – PAST v. 3.15 бойынша; сорттардың туыстық матриксы – TASSEL v. 5.2.24. бойынша бағаланды. Изучена реакция гермоплазмы пшеницы на устойчивость к расам и хозяин-специфичным токсинам гриба S. nodorum. Выявлена гермоплазма пшеницы, устойчивая к расам и токсинам гриба. Проведена полевая оценка гермоплазмы пшеницы в 2 контрастных регионах Казахстана на устойчивость к септориозу. Проведено генотипирование коллекции образцов пшеницы с использованием технологии секвенирования нового поколения DArTseq™ с использованием SNP-маркеров. Наибольшее количество маркеров было картировано в субгеномах A и B (44,3 и 47,5%, соответственно). Идентифицировано 70 генотипов с Stb генами устойчивости, включающие 18 носителей гена Stb2 (8,18%); 28 – Stb4 (12,72%); 7 – Stb7 (3.18%) и 17 – Stb8 (8,18%). Бидай гермоплазмасының расаларға және S. nodorum саңырауқұлағы өндіретін қожайын-спецификалық токсиндерге төзімділігіне реакциясы зерттелді. S. nodorum расасына және токсиніне төзімді бидай гермоплазмасы анықталды. Қазақстанның 2 қарама-қарсы өңірінде (Алматы және Қостанай облыстары) ересек өсімдіктердің септорияға төзімділігіне бидай гермоплазмасына далалық бағалау жүргізілді. DArTseq™ жаңа буын секвенирлеу технологиясын және SNP маркерлерін пайдалана отырып, бидай үлгілерінің жинағын генотиптеу жүргізілді. Маркерлердің ең көп саны А және В субгеномдарында картаға түсірілді (сәйкесінше 44,3 және 47,5%). Stb2 генінің 18 тасымалдаушысын (8,18%) қамтитын төзімділік гендері бар 70 Stb генотипі; 28 Stb4 генінің тасымалдаушысы (12,72%); 7 Stb7 генінің тасымалдаушысы (3.18%) және 17 Stb8 генінің тасымалдаушысы (8,18%) анықталды. Проведен поиск ассоциаций маркер-признак для устойчивости к септориозу в панели пшеницы сортов и линий пшеницы на основании реакции к расам и токсинам SNB и данных полевой устойчивости к болезни. На основе GWAS идентифицированы QTL и ассоциации маркер-признак (MTA). Оценены межгенные взаимодействия с несколькими QTL между ассоциированными SNP. Выявлены наиболее предпочтительные аллельные комбинации и перспективные линии пшеницы, характеризующиеся устойчивостью к септориозу. План публикаций по теме за 2022-2024 г.г. выполнен (Приложение А). GWAS негізінде QTL және маркер-белгі қауымдастығы (MTA) анықталды. Байланысты SNP арасындағы бірнеше QTL-мен интергендік өзара әрекеттесу бағаланады. Септорияға төзімділікпен сипатталатын ең қолайлы аллельді комбинациялар мен бидайдың перспективалы сызықтары анықталды. 2022-2024 ж. ж. тақырып бойынша жарияланымдар жоспары орындалды (А Қосымшасы). в качестве перспективного материала в селекции на устойчивость к септориозу рекомендуется использовать отобранные генотипы пшеницы с лучшими комбинациями аллелей SNP, ассоциированных с устойчивостью к изолятам и токсинам септориоза. ҒЗЖ нәтижелерін енгізу бойынша ұсыныстар: септорияға төзімділік селекциясында перспективті материал ретінде таңдалған бидай генотиптерін изоляттар мен септория токсиндеріне төзімділікпен ассоциацияланған SNP аллельдерінің ең жақсы комбинацияларымен пайдалану ұсынылады. использование устойчивых к болезни сортов пшеницы принесет прибыль, равную 20%-ной стоимости продукции. Жұмыстың экономикалық тиімділігі немесе маңыздылығы: ауруға төзімді бидай сорттарын пайдалану өнімнің 20% құнына тең пайда әкеледі. молекулярная генетика и селекция растений, фитопатология. молекулалық генетика және өсімдік селекциясы, фитопатология. |
||
UDC indices | ||
633.1; 632.4; 577.2 | ||
International classifier codes | ||
34.23.57; 34.15.23; | ||
Readiness of the development for implementation | ||
Key words in Russian | ||
полногеномное ассоциативное картирование; пшеница; Septoria Nodorum; генотипирование; молекулярные маркеры; | ||
Key words in Kazakh | ||
бүкіл геномдық ассоциативті карталау; бидай; Septoria Nodorum; генотиптеу; молекулалық маркерлер; | ||
Head of the organization | Жамбакин Кабыл Жапарович | Доктор биологических наук / профессор |
Head of work | Кохметова Алма Мырзабековна | Доктор биологических наук / Академик НАН РК, профессор |
Native executive in charge |