Inventory number IRN Number of state registration
0224РК00099 AP14869967-OT-24 0122РК00313
Document type Terms of distribution Availability of implementation
Заключительный Gratis Number of implementation: 0
Not implemented
Publications
Native publications: 2
International publications: 2 Publications Web of science: 1 Publications Scopus: 1
Number of books Appendicies Sources
1 4 39
Total number of pages Patents Illustrations
68 0 13
Amount of funding Code of the program Table
29235101.35 AP14869967 7
Name of work
Картирование генетических факторов, детерминирующих устойчивость к Septoria nodorum, на основе полногеномного исследования ассоциаций в коллекции гексаплоидной пшеницы
Report title
Type of work Source of funding The product offerred for implementation
Fundamental Коллекции
Report authors
Кохметова Алма Мырзабековна , Кумарбаева Мадина Талгаровна , Кеишилов Женис Советканович , Жанузақ Данна Көмекқызы , Болатбекова Ардак Айдыновна , Бахытұлы Қанат , Малышева Ангелина Александровна , Кохметова Асия Мырзабековна , Мухаметжанов Канат Серикханович ,
0
0
0
0
Customer МНВО РК
Information on the executing organization
Short name of the ministry (establishment) МНВО РК
Full name of the service recipient
Республиканское Государственное предприятие на праве хозяйственного ведения "Институт Биологии и биотехнологии растений"
Abbreviated name of the service recipient РГП на ПХВ «ИББР»
Abstract

220 казахстанских и зарубежных сортов и линий гексаплоидной пшеницы

Гексаплоидты бидайдың 220 қазақстандық және шетелдік сорттары мен линияларынан тұратын коллекциясы.

Картирование генетических факторов, детерминирующих устойчивость к Septoria nodorum, на основе полногеномного исследования ассоциаций в коллекции гексаплоидной пшеницы

Қазақстандық гексаплоидты бидай коллекциясының бүкіл геномдық ассоциацияларын зерттеу (GWAS) негізінде Septoria nodorum төзімділігін айқындайтын генетикалық факторларды карталау.

оценка полевой устойчивости к S. nodorum – по методике Saari, Prescott (1975); оценка проростковой устойчивости к расам гриба – по шкале Lamari, Bernier (1989); структуру популяции оценивали по программе STRUCTURE 2.3.4; PCA анализ – по PAST v.3.15; матрикс родства сортов – по TASSEL v. 5.2.24.

S. nodorum-ға егіс алқабындағы төзімділікті бағалау – Saari, Prescott әдістемесі бойынша (1975); саңырауқұлақ расаларына өскіндегі төзімділікті бағалау – Lamari, Bernier шкаласы бойынша (1989); популяция құрылымы STRUCTURE 2.3.4 бойынша; PCA талдауы – PAST v. 3.15 бойынша; сорттардың туыстық матриксы – TASSEL v. 5.2.24. бойынша бағаланды.

Изучена реакция гермоплазмы пшеницы на устойчивость к расам и хозяин-специфичным токсинам гриба S. nodorum. Выявлена гермоплазма пшеницы, устойчивая к расам и токсинам гриба. Проведена полевая оценка гермоплазмы пшеницы в 2 контрастных регионах Казахстана на устойчивость к септориозу. Проведено генотипирование коллекции образцов пшеницы с использованием технологии секвенирования нового поколения DArTseq™ с использованием SNP-маркеров. Наибольшее количество маркеров было картировано в субгеномах A и B (44,3 и 47,5%, соответственно). Идентифицировано 70 генотипов с Stb генами устойчивости, включающие 18 носителей гена Stb2 (8,18%); 28 – Stb4 (12,72%); 7 – Stb7 (3.18%) и 17 – Stb8 (8,18%).

Бидай гермоплазмасының расаларға және S. nodorum саңырауқұлағы өндіретін қожайын-спецификалық токсиндерге төзімділігіне реакциясы зерттелді. S. nodorum расасына және токсиніне төзімді бидай гермоплазмасы анықталды. Қазақстанның 2 қарама-қарсы өңірінде (Алматы және Қостанай облыстары) ересек өсімдіктердің септорияға төзімділігіне бидай гермоплазмасына далалық бағалау жүргізілді. DArTseq™ жаңа буын секвенирлеу технологиясын және SNP маркерлерін пайдалана отырып, бидай үлгілерінің жинағын генотиптеу жүргізілді. Маркерлердің ең көп саны А және В субгеномдарында картаға түсірілді (сәйкесінше 44,3 және 47,5%). Stb2 генінің 18 тасымалдаушысын (8,18%) қамтитын төзімділік гендері бар 70 Stb генотипі; 28 Stb4 генінің тасымалдаушысы (12,72%); 7 Stb7 генінің тасымалдаушысы (3.18%) және 17 Stb8 генінің тасымалдаушысы (8,18%) анықталды.

Проведен поиск ассоциаций маркер-признак для устойчивости к септориозу в панели пшеницы сортов и линий пшеницы на основании реакции к расам и токсинам SNB и данных полевой устойчивости к болезни. На основе GWAS идентифицированы QTL и ассоциации маркер-признак (MTA). Оценены межгенные взаимодействия с несколькими QTL между ассоциированными SNP. Выявлены наиболее предпочтительные аллельные комбинации и перспективные линии пшеницы, характеризующиеся устойчивостью к септориозу. План публикаций по теме за 2022-2024 г.г. выполнен (Приложение А).

GWAS негізінде QTL және маркер-белгі қауымдастығы (MTA) анықталды. Байланысты SNP арасындағы бірнеше QTL-мен интергендік өзара әрекеттесу бағаланады. Септорияға төзімділікпен сипатталатын ең қолайлы аллельді комбинациялар мен бидайдың перспективалы сызықтары анықталды. 2022-2024 ж. ж. тақырып бойынша жарияланымдар жоспары орындалды (А Қосымшасы).

в качестве перспективного материала в селекции на устойчивость к септориозу рекомендуется использовать отобранные генотипы пшеницы с лучшими комбинациями аллелей SNP, ассоциированных с устойчивостью к изолятам и токсинам септориоза.

ҒЗЖ нәтижелерін енгізу бойынша ұсыныстар: септорияға төзімділік селекциясында перспективті материал ретінде таңдалған бидай генотиптерін изоляттар мен септория токсиндеріне төзімділікпен ассоциацияланған SNP аллельдерінің ең жақсы комбинацияларымен пайдалану ұсынылады.

использование устойчивых к болезни сортов пшеницы принесет прибыль, равную 20%-ной стоимости продукции.

Жұмыстың экономикалық тиімділігі немесе маңыздылығы: ауруға төзімді бидай сорттарын пайдалану өнімнің 20% құнына тең пайда әкеледі.

молекулярная генетика и селекция растений, фитопатология.

молекулалық генетика және өсімдік селекциясы, фитопатология.

UDC indices
633.1; 632.4; 577.2
International classifier codes
34.23.57; 34.15.23;
Readiness of the development for implementation
Key words in Russian
полногеномное ассоциативное картирование; пшеница; Septoria Nodorum; генотипирование; молекулярные маркеры;
Key words in Kazakh
бүкіл геномдық ассоциативті карталау; бидай; Septoria Nodorum; генотиптеу; молекулалық маркерлер;
Head of the organization Жамбакин Кабыл Жапарович Доктор биологических наук / профессор
Head of work Кохметова Алма Мырзабековна Доктор биологических наук / Академик НАН РК, профессор
Native executive in charge